Universitas Samudra berdiri atas inisiasi dari sebuah universitas swasta yang dikelola oleh Yayasan Pendidikan Samudra dan berdomisili di Kota Langsa. Oleh karena itu, Perguruan Tinggi Swasta ini semula dikenal dan diberi nama Universitas Samudra Langsa. Universitas Samudra Langsa sebelumnya merupakan wilayah Kabupaten Aceh Timur yang telah mulai dirintis oleh para pendirinya sejak tahun 1963. Saat itu sebuah organisasi bernama Al- Jamiatul Wasliyah Cabang Aceh Timur berinisiatif dengan mendirikan lembaga pendidikan tinggi  yaitu Fakultas Ekonomi Malikul Saleh. Kampus ini masih berafiliasi dengan Universitas Alwasliyah Medan, Sumatera Utara dalam bidang pendidikan atau pengajarannya.